琅琊区下辖8个街道：琅琊街道、丰山街道、清流街道、扬子街道、西涧街道、遵阳街道、滁阳街道、三官街道、凤凰街道、紫薇街道，区政府驻欧阳修大道。

1992年，滁州撤地设市。原县级滁州市一分为二，建立琅琊区和南谯区。1993年，琅琊区成立，因境内琅琊山及原滁县琅琊乡而取名琅琊区。