崖州区下辖8个社区、24个行政村、1个南滨居，区政府驻三亚市崖州区崖州大道。

崖州是海南历史最悠久的城郡，是中央政府在海南设立最早的行政建制之一，1985年，建崖城镇，2014年，撤销三亚市崖城镇，设立三亚市崖州区。