巴马瑶族自治县下辖3个镇（巴马镇、甲篆镇、燕洞镇）和7个乡（那社乡、所略乡、西山乡、东山乡、凤凰乡、百林乡、那桃乡），县政府驻地位于巴马镇新建路。

巴马瑶族自治县历史悠久，早在两万年前就有先民繁衍生息。县域最早设立县级以上行政建置始于宋朝崇宁年间。近年来，巴马荣获多项殊荣，包括“世界长寿之乡·中国人瑞圣地”、“中国香猪之乡”、“国家卫生乡镇（县城）”、“全国绿化模范单位”等，展现了其独特的自然环境和人文魅力。