红原县下辖6镇4乡：邛溪镇、刷经寺镇、安曲镇、瓦切镇、龙日镇、色地镇、麦洼乡、阿木乡、江茸乡、查尔玛乡。

红原县境，西汉属汶山郡。晋、隋袭旧制。唐代，在刷经寺地区设有恭州、流县。