自流井区辖9个街道、3个镇：五星街街道、东兴寺街道、新街街道、郭家坳街道、丹桂街道、学苑街道、舒坪街道、红旗街道、高峰街道，仲权镇、荣边镇、飞龙峡镇，区政府驻丹桂北大街。

自流井区古代属《禹贡》梁州之域，秦代属蜀郡辖地，汉代属犍为郡江阳县。明嘉靖年间改属富顺县。民国二十八年（1939年）因盐设市，1953年，命名为自流井区。自流井区是成渝经济区轴心地带和川南五地市中心，是“一带一路”和四川南向大通道重要节点。自流井区境内有国家级文物保护单位西秦会馆、桓侯宫，有中国生产时间最长的天然气井—小桥井。飞龙峡风景区是国家AAAA级自然生态旅游风景区和国家级水利风景区、省级森林公园，拥有20平方千米的自然生态旅游资源，森林面积达3200公顷。