南山区辖8个街道：南山街道、南头街道、西丽街道、沙河街道、蛇口街道、招商街道、粤海街道、桃源街道，另辖1个合作区：前海合作区。区政府驻南头街道桃园路。

先秦时期，今南山地域为百越地。秦代，属南海郡番禺县。民国元年（1912年），属新安县。1984年，属蛇口区。1990年，南山区正式成立。