鲅鱼圈区下辖3个街道、3个镇：红海街道、海星街道、望海街道、熊岳镇、芦屯镇、红旗满族镇。

清朝时，每年五月节、八月节是鲅鱼盛产期，外来渔船骤增，都集聚在望海寨南5公里的西关屯一带海边落脚，并以此为中心交易鲅鱼，后称为鲅鱼圈。1984年1月27日，撤销盖县鲅鱼圈乡，设立营口市鲅鱼圈区，故名。