方正县辖5个镇，4个乡：方正镇、会发镇、大罗密镇、得莫利镇、高楞镇、天门乡、松南乡、德善乡、宝兴乡。

清宣统元年(1909)由大通县析置，因县城北门外有方正泡而名，据《中国地名由来词典》：有湖名方正泡，其形方正故名；另说方正泡最初膀头泡，设县时曾以此作为地名，后雅化方正为县名，亦称此泡为方正泡。清代，属吉林将军辖区。清末，方正泡一带，属大通县（今通河县）跨江设治管辖。1909年6月2日（清宣统元年四月十五日），清廷批准，将原大通县所属江南方正泡地方划出，设置方正县，驻方正泡街，隶属依兰府。1991年4月，改为哈尔滨市管辖。