克东县下辖5个镇、2个乡：克东镇、宝泉镇、乾丰镇、玉岗镇、蒲峪路镇、润津乡、昌盛乡。县政府驻克东镇。

金代，在此设蒲峪路，1929年克山县东境析置克东设治局，1930年改设克东县，因县治在克山之东得名；另据《中国地名由来词典》：原属克山县,后从克山县东境划出析置，故名。1985年，嫩江地区与齐齐哈尔市合并，再归齐齐哈尔市。